第一節、海關
海關是報關公司的主管單位,報關行依法按程序代理客戶向海關申報進出口貨物(很多工廠和外貿公司有自理報關權)。海關的其它基本職能還包括：監管、征稅、統計、緝私。以大鵬海關為例，大鵬海關業務科包括：綜合業務科、碼頭監管科、轉關科、調查科、船管科、辦公室、人保科、行政財務科。
深圳海關分一線海關和二線海關（有沒有三線海關不清楚）。一線海關指申報之后直接可以出境的海關。而二線海關指申報之后必須再通過一線海關再報關才能出口的海關。
深圳海關總署共有幾個一線海關：
大鵬海關、蛇口海關、文錦渡海關、皇崗海關、沙頭角海關，其中蛇口海關又包括以下幾個碼頭；SCT （SHEKOU）、赤灣（CHIWAN，赤灣碼頭在凱豐碼頭對面，現已合并為一家公司對外稱赤灣）、媽灣（MAWAN ）、招港（ZHAOGANG）、東角頭（進口碼頭）。其中中港拖車—陸路口岸：文錦渡、皇崗、沙頭角

一線海關當中又分為船運和路運海關，五個一線海關當中大鵬海關和蛇口海關為船運海關，文錦渡海關、皇崗海關、沙頭角海關為路運海關。
二線海關如筍崗海關、福田保稅區海關等。鹽田的怡和倉、文輝物流、馬士基物流等保稅倉直接向大鵬海關申報。湖北倉、梅園倉、603倉等海關監管倉庫向筍崗海關申報。
第二節、報關所需單證
一、出口報關所需報關資料
1．一般貿易報關所需報關資料：
. 報關委托單(一式兩份,蓋公章)
2). 貨物出口報關單(一式兩份,蓋報關專用章，有的貨物入海關監管倉需蓋公章)

存(出)倉委托書(蓋公章)，整柜出口不需要存（出）倉委托書。

 裝箱單(一式兩份,蓋公章)
 發票(一式兩份,蓋財務專用章或公章)
6). 銷售合同正本(一式兩份,蓋合同專用章或公章)（注意有效期和企業代碼和貿易條款，當貿易條款為CIF或C&F時，需提供買賣單價）
7). 核銷單(一式一份,蓋公章)
8). 其它必需的證書，如商檢、動植檢、許可證、配額等
 重柜紙（有的船公司需要，其中鹽田一定要，蛇口有一部分船公司需要，比如MSC，但有的船公司則不需要）
2、手冊報關
對于三資企業來說，如果做的是來料加工或進料加工，則用手冊報關+核銷單，其它所需報關資料同一般貿易。來料加工指工廠沒有進出口權，接到國外客戶訂單加工之后再出口給國外客戶，工廠不負責出口銷路，來料加工只收取工繳費。來料加工出口的核銷單需到外經委加蓋章。進料加工的工廠可以自行出口，自己選擇貿易商。
3、轉關
1).轉關紙(蓋以發貨人、車行章)，異地海關放行章。
2).出口報關單3).重柜紙（有的船公司需要，有的船公司不需要）
4).司機本(必須在起運地或指運地備案)
4、清單報關，指工廠用集中報關單出口報關，只能用在文錦渡及皇崗和沙頭角。
二、進口報關:
1．一般貿易進口報關:
1).報關委托書(蓋收貨人章)
2).裝箱單(蓋發貨人章)
3).發票(蓋發貨人章)
4).合同
5).提單(B/L)
6).提貨單(D/O)
7).商檢、動植檢、許可證等海關所需單證
2、進口轉關所需報關資料：
1).發票(發貨人章)
2).裝箱單(發貨人章)
3).司機紙(轉關紙)(發貨人、收貨人、車行章)
4).提單(B/L)
5).提貨單（D/O）
6).司機本(大鵬海關備案)
第三節、報關操作流程：(以深圳地區海關爲例)
一、 出口報關流程
1．一般貿易
1. 查電腦艙單，即重柜有沒有還場（有重柜紙，如果海關電腦里沒有資料也不行）
2. 到船公司編號(如果是駁船，請向船公司確認船名)
3. 輸單（必須是跟海關聯網的報關行才能輸單）
4. 核查核銷單、船名航次等基本資料，確認無誤后發送至審單中心（審單中心在總關）
5. 審單中心回執、打印報關單6. 遞單報關(若查柜，則安排查驗計劃，由報關員工協助查驗)
7. 放行(收放行單)